В 17 июня 1996 года по приказу ректора был организован центр «Переподготовки и повышения квалификации кадров».
Директором организатором центра был назначен к.п.н., доцент Дарбанов М.Е.  

1997-году по приказу ректора был назначен директором центра к.ф.-м.н, доцент К.Болотбаев.
 В этом же году получили лицензию за номером №066 Министерства образования Кыргызской Республики и впервые зачислили 
300 студентов по 19 специальностям. 

15 – февраля 2000 – года по постановлению Ученого Совета центр реорганизован в факультет «Переподготовки и подготовки кадров».   

В 27 июля 2005-года по приказу ректора деканом факультета была назначена к.п.н., доцент А Ураимхалилова.

С 10 сентября 2007 года до 25 ноября 2007 года к.т.н., доцент Койчуманов Т. работал деканом факультета.   

С 25 ноября 2007 года до 20 июля 2009 года Ураимхалилова А проработала деканом данного факультета.

                14 июля 2009 года по постановлению ученого Совета ЖАГУ и приказа ректора, факультет «Переподготовки и подготовки кадров» вместе 
с отделом практики и выпускников, и на базе естественно-гуманитарного лицея, был преобразован в Институт непрерывного образования. 

        Директором института был назначен, доктор технических наук, профессор Каримов Абдыкадыр Каримович.